Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.9 ms