Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4GALTQ9NPC4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms