Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms