Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms