Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM15Q9C019 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms