Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144 ms