Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms