Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms