Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms