Protein–RNA interactions for Protein: Q99624

SLC38A3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A3Q99624 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC38A3Q99624 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC38A3Q99624 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC38A3Q99624 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC38A3Q99624 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC38A3Q99624 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A3Q99624 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms