Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms