Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.1 ms