Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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