Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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