Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
WDR88Q6ZMY6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
WDR88Q6ZMY6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
WDR88Q6ZMY6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
WDR88Q6ZMY6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
WDR88Q6ZMY6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
WDR88Q6ZMY6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
WDR88Q6ZMY6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
WDR88Q6ZMY6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
WDR88Q6ZMY6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
WDR88Q6ZMY6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
WDR88Q6ZMY6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
WDR88Q6ZMY6 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms