Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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