Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWI1

TCERG1L, Transcription elongation regulator 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCERG1LQ5VWI1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCERG1LQ5VWI1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms