Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP188Q5SRE5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP188Q5SRE5 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms