Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms