Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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SP6Q3SY56 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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SP6Q3SY56 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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SP6Q3SY56 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
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SP6Q3SY56 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
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