Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms