Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms