Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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