Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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