Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
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