Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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