Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms