Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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RPE65Q16518 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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RPE65Q16518 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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RPE65Q16518 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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RPE65Q16518 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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RPE65Q16518 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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