Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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ZFHX3Q15911 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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ZFHX3Q15911 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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ZFHX3Q15911 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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ZFHX3Q15911 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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ZFHX3Q15911 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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