Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms