Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
EEA1Q15075 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms