Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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RFTN1Q14699 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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RFTN1Q14699 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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RFTN1Q14699 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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RFTN1Q14699 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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RFTN1Q14699 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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