Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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