Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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KCNC3Q14003 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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KCNC3Q14003 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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KCNC3Q14003 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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KCNC3Q14003 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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