Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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