Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAPSNQ13702 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAPSNQ13702 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAPSNQ13702 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAPSNQ13702 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAPSNQ13702 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAPSNQ13702 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAPSNQ13702 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAPSNQ13702 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAPSNQ13702 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAPSNQ13702 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAPSNQ13702 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAPSNQ13702 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAPSNQ13702 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAPSNQ13702 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAPSNQ13702 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAPSNQ13702 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAPSNQ13702 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAPSNQ13702 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAPSNQ13702 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RAPSNQ13702 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAPSNQ13702 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAPSNQ13702 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAPSNQ13702 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAPSNQ13702 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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