Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2Q13563 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
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