Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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