Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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