Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME3Q13232 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME3Q13232 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME3Q13232 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME3Q13232 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME3Q13232 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME3Q13232 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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