Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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IFT88Q13099 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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IFT88Q13099 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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IFT88Q13099 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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IFT88Q13099 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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IFT88Q13099 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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IFT88Q13099 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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IFT88Q13099 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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