Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACACAQ13085 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms