Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
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PRDM2Q13029 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
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PRDM2Q13029 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
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PRDM2Q13029 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
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PRDM2Q13029 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
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PRDM2Q13029 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
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PRDM2Q13029 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
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PRDM2Q13029 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
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PRDM2Q13029 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
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PRDM2Q13029 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
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PRDM2Q13029 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
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