Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms