Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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