Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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KCNMA1Q12791 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
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KCNMA1Q12791 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMA1Q12791 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.46
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KCNMA1Q12791 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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KCNMA1Q12791 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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KCNMA1Q12791 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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KCNMA1Q12791 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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KCNMA1Q12791 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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KCNMA1Q12791 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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KCNMA1Q12791 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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KCNMA1Q12791 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
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KCNMA1Q12791 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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KCNMA1Q12791 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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