Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NIPAL4Q0D2K0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms