Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD47Q08722 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD47Q08722 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms