Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXM1Q08050 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms