Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms